2.1下载物种分布数据

2.1.1 下载物种分布平台：

## ropensci提供开放的生物多样性和基因组数据分析R包：
## 数据链接： 
https://ropensci.org/

## 下载物种分布数据R包：spocc
## 提供七个主要联合生物多样性数据共享平台下载和可视化以及清理

## R包安装：
install.packages("spocc")
# or install the most recent version
devtools::install_github("ropensci/spocc")
library(spocc)

## ModestR Software
## GBIF下的软件开发工具，用于下载GBIF的物种分布数据和可视化；
## 软件链接：
http://www.ipez.es/ModestR/

2.1.1.1 全球生物多样性开放联合平台

## GBIF
全球生物多样性信息基金（rgbif） GBIF是政府资助的开放数据存储库，拥有多个合作伙伴组织，其明确目标是提供对地球生物多样性数据的访问。数据由成员节点网络提供，可协调来自各种参与组织和政府机构的信息。


## ecoengine(古博物馆数据)
伯克利生态引擎（伯克利生态引擎ecoengine）是由伯克利全球变化生物学计划建立的开放API 。该资料库可访问伯克利各个自然历史博物馆的300万个标本。这些数据跨越一个多世纪，可以访问地理参考的标本，物种清单，照片，植被调查和再调查以及位于加州大学自然保护区系统自然保护区的环境传感器进行的各种测量。
## 网站链接：
https://ecoengine.berkeley.edu/

## iNaturalist(公民数据)
## 网站描述：
iNaturalist通过iNaturalist，可以访问有关物种观察的人群来源的公民科学数据。
## 网站链接：
https://www.inaturalist.org/

## iDigBio全球的动植物网站物种分布库
https://www.idigbio.org/

## IUCN濒危物种红色名录
https://www.iucnredlist.org/search?query=Hippophae&searchType=species

## 生命地图-动物物种地图
https://mol.org/species/

## 全球山区生物多样性评估
http://www.mountainbiodiversity.org/explore

## 全球海洋生物信息数据集：
https://obis.org/

## 物种链接网络
http://www.splink.org.br/index?lang=pt

## wiki提供的全球生物多样性数据清单：
https://en.wikipedia.org/wiki/List_of_biodiversity_databases

## 联合国提供的全球生物多样性在线平台：
https://biodiversitytools.com/databases/

## 个人实验室汇总
https://kevintshoemaker.github.io/NRES-746/Links.html

2.1.1.2 动物数据多样性平台

## VertNet(动物数据)
VertNet（rvertnet）与rgbif，ecoengine和rbison（见下文）类似，VertNet提供了超过8000万条脊椎动物记录的访问记录，这些记录跨越了许多机构和博物馆，主要覆盖了四个主要学科（哺乳动物，爬虫，鸟类学和昆虫学）。

## eBird(鸟类数据平台)
eBird（rebird）ebird是由康奈尔大学鸟类学实验室和美国国家奥杜邦学会开发和维护的数据库。它提供对清单数据，鸟类数量和分布的数据以及鸟类观察者的公共报告的实时访问。

## AntWeb(蚂蚁数据平台)
AntWeb（AntWeb）AntWeb是世界上最大的有关蚂蚁的图像，标本记录和自然历史信息的在线数据库。它是社区驱动的，并欢迎任何有标本记录，自然历史注释或图像的人做出贡献。（相关博客文章）

## Biotrack - 动物监测专家
http://www.biotrack.co.uk/

2.1.1.3 植物数据多样性平台

## 生物多样性对陆地生态系统的响应(PREDICTS)数据集
## 网站信息查看：
https://www.predicts.org.uk/
##数据链接下载链接：
https://data.nhm.ac.uk/

## 植物功能数据库：
https://www.try-db.org/TryWeb/Home.php

## 全球植被数据库(植被地块索引的数据库)
https://www.givd.info/index.xhtml

## 邱园植物标本室目录
## 提供标本和图像的描述：
##数据链接：
http://apps.kew.org/herbcat/navigator.do

## 邱园补充：
# 在邱园的登录网站中提供数十个植物数据库相关的标本清单链接：
http://www.theplantlist.org/tpl1.1/record/kew-2851557
## 包含地址有：
非洲植物数据库、纽约植物园虚拟植物标本室；巴西植物数据库等等。

## 日内瓦植物标本馆：
http://www.ville-ge.ch/cjb/

### 纽约植物标本馆：The New York Botanical garden Virtual herbarium
https://www.nybg.org/

## 巴西植物标本馆：
http://floradobrasil.jbrj.gov.br/reflora/PrincipalUC/PrincipalUC.do?lingua=en

## World Checklist of Selected Plant Families(WCSR)
##  提供全球植物数据库的审核平台，，但检索麻烦，且检索不到。

2.1.1.3 国家数据多样性平台

2.1.1.3.1 欧盟数据多样性平台

## 瑞典：
## 瑞典农业科学大学
## 网站链接：
https://www.slu.se/centrumbildningar-och-projekt/skud/vaxtnamn/

## 葡萄牙
## 网站链接：
http://www.splink.org.br/index?lang=pt&action=openform

## NBN Atlas-英国最大的生物多样性信息收集
https://nbnatlas.org/

## 欧洲繁殖鸟图集
https://www.ebba2.info/

## 欧洲鸟类数据观测点
https://eurobirdportal.org/ebp/en/about/

## 欧盟生物多样性数据中心
## 网站简述：数据开放，注册可检索；
# BiodivERsA是一个由国家和地区资助组织组成的网络，旨在促进泛欧对生物多样性和生态系统服务的研究，并为生物多样性的保护和可持续管理提供创新机会
## 未知原因，网站注册后无法使用；
http://www.biodiversa.org/
https://www.biodiversa.org/database/signup

## 欧盟 nature 2000
## 它是保护区的生态网络，旨在确保欧洲最有价值的物种和栖息地的生存
https://www.eea.europa.eu/data-and-maps/data/natura-11
它是保护区的生态网络，旨在确保欧洲最有价值的物种和栖息地的生存

## 土耳其生物多样性及农业数据
## 需要内网进入；
https://www.tarimorman.gov.tr/DKMP/Menu/20/Biyocesitlilik-Istatistikleri

## 欧洲环境署（EEA ）管理的生物多样性数据中心（BDC）
##网站链接：和nature 2000计划密切相关；
https://biodiversity.europa.eu/data

2.1.1.3.2 中国数据多样性平台

### PPBC中国植物图像库——最大的植物分类图片库
## 网站链接：
http://ppbc.iplant.cn/

## NSII-中国国家标本资源平台 
http://159.226.89.35:8086/SpeciesMapping/SpeciesMappingTool.html?spname=%E6%9F%B3%E5%8F%B6%E6%B2%99%E6%A3%98

## 中国自然标本馆
http://www.cfh.ac.cn/

## 植物彩色图片--CVH中国数字植物标本馆
http://www.cvh.ac.cn/ppbc/%E7%BA%A2%E6%9D%89

## FOC,Flora of China 《中国植物志》英文修订版 官方网站
http://foc.iplant.cn/

## 中国植物志网-网站地图-中文
http://flora.huh.harvard.edu/china/mss/site_map.htm

## Specimens — Biodiversity of the Hengduan Mountains
## 恒横断山脉生物多样性统计；
http://hengduan.huh.harvard.edu/fieldnotes/specimens、

## biotracks
由中国多所植物所综合承办，由中国科学院昆明植物研究所主办，数据可共享
http://www.biotracks.cn/

## 中国动物主题数据库
## 中科院动物所发布：包含了22个中国动物学研究的子数据库及其信息服务平台，如中国动物志、中国动物图谱、鸟类、蜜蜂、内陆水体鱼类、两栖和爬行类、直翅目昆虫、云南蝴蝶、昆虫模式标本、濒危和保护动物、动物名称等数据库。使用者可以通过关键词搜索、分类系统浏览或地图地点选择等方式查询中国动物物种的数据。
http://www.zoology.csdb.cn/

## 亚洲生物多样性保护网络
http://abcdn.org/zh-hans/node/63

## 中国生物多样性与生态安全大数据平台：(算是最有用的平台了。。)
http://bio-one.net/BIS.html
## 在下面这个网站可以查看中国范围内生物多样性的监测信息：
http://bio-one.net/statis.aspx
## 在下面这个网站可以查看：


## 东盟生物多样性数据平台：
https://aseanbiodiversity.org/    

## 中国sp2000 物种名录
http://www.sp2000.org.cn/

## 中国植物物种信息数据库：
http://db.kib.ac.cn/

##  中国数字植物园：
http://cvbg.iplant.cn/index.aspx

## MapBio
MapBio是中国科学院发起的一个项目，旨在整合来自不同来源的物种分布数据，并绘制中国生物多样性的图谱，以支持生物多样性研究和生物多样性保护决策。其中包含了一部分关于一带一路相关的研究课题；
http://map.especies.cn/#

2.1.1.3.3 美洲

## BISON-Home --主要包含南美物种分布数据库
https://bison.usgs.gov/#home

## Plants Profile for Paeonia suffruticosa (moutan peony)m美国植物资源保护中心
https://plants.usda.gov/core/profile?symbol=PASU39

2.1.1.3.4 澳洲

## 澳大利亚国家植物园 - 植物门户网站
http://www.cpbr.gov.au/index.html

## 澳大利亚生物多样性网站
https://www.ala.org.au/

2.1.1.4 物种入侵专题数据库

## 中国外来入侵物种数据库
## 网站链接：
http://www.chinaias.cn/wjPart/index.aspx#

## 国家入侵物种信息中心（NISIC）
## 网站链接：
https://www.invasivespeciesinfo.gov/
# 美国——©乔治亚大学-入侵物种与生态系统健康中心
## 网站说明：信息十分详细，需要注册后下载使用：
https://www.eddmaps.org/distribution/viewmap.cfm?freg
##美国农业部——国家外来入侵物种信息中心：
https://www.invasivespeciesinfo.gov/aquatic/plants/alligatorweed/resources

## EPPO全球数据库
EPPO全球数据库由欧洲和地中海植物保护组织（EPPO）秘书处维护。该数据库的目的是提供由EPPO生产或收集的所有有害生物特定信息.EPPO是一个政府间组织，负责欧洲地中海地区植物健康方面的合作。EPPO由15个欧洲国家成立于1951年，现在有52个成员。其目标是通过制定国际战略，防止对农业，林业和环境构成威胁的有害生物的传入和扩散，
# 网站链接：
https://gd.eppo.int/

## 全球植物入侵数据库：
## 网站链接：
http://www.iucngisd.org/gisd/

## 北美的入侵种研究：
## 网站链接：
https://www.invasive.org/index.cfm

## 欧盟物种入侵研究中心CABI
## 网站链接：
https://www.cabi.org/isc/

## 太平洋岛屿生态系统检测中心
http://www.hear.org/pier/

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